下記 javascript を調整していただけますでしょうか？

[ 調整前 ]
let scrollPoint = next.getBoundingClientRect().top + window.pageYOffset;

[ 調整後 ]
let scrollPoint = next.getBoundingClientRect().top + window.pageYOffset - 50; //50px 上部に余白を持たせてます。こちらの数値はお好みで調整してください。