コードが全て見えないので同様のことをやってみての予想ですが、

①点滅widgetを入れる
②文字を書き換えてbrで改行をつける
③spanタグを使った装飾をする（伸縮マーカーなど）

とすると

①②
<span class="flash">サンプル<br>テキスト</span>

では問題なく点滅していると思いますが

③
<span class="flash">
 <span 装飾の色々>サンプル</span></span><br>
<span 装飾の色々>テキスト</span>

となり、上側しか点滅しない、下側の位置がおかしいとなるのかな…と想定しております。なので、下側にも

<span class="flash">
 <span 装飾の色々>サンプル</span></span><br>
<span class="flash">
 <span 装飾の色々>テキスト</span>
</span>

でflashクラスのspanタグで囲ってみてあげてください！